病羊会出现发烧情况。背毛无光，口鼻干燥，食欲差。流黏液脓性鼻漏、口腔黏膜充血，导致多涎，会出现坏死性病灶。感染动物的临床症状类似于牛瘟。主要感染山羊、绵羊、羚羊、美国白尾鹿等小反刍动物，山羊发病比较严重。
小反刍兽疫是小反刍兽疫病毒引起的一种以发热、口炎、腹泻和肺炎为特征的急性病毒病。山羊发病严重，绵羊也偶有严重的病例发生。一些康复山羊的唇部形成口疮样病变。急性型体温可上升至41℃，并持续3～5天。感染动物烦躁不安。
