临床上较难区别，猪口蹄疫是由口蹄疫病毒引起，猪水泡病由水泡病毒引起，口蹄疫对小猪死亡率较高，心肌炎虎斑心，水泡病只发生于猪，口蹄疫除猪发病，牛羊等偶蹄类动物都可发生;口蹄疫体温较高，水泡病体温一般不高;口蹄疫有七个血清型，70多个亚型，猪水泡病只一个血清型。
猪口蹄疫与猪水泡病的区别。1,体温，口蹄疫常伴有发烧，而水泡病基本不烧正常。2,口蹄疫传播速度快，而水泡病常成跳跃式传播。3,口蹄疫常伴有心肌炎，小猪有胃肠炎症状引起死亡，而水泡病在无细菌感染的情况下不死亡。4,口蹄疫常见四蹄同时发生水泡，而水泡病一蹄或两蹄发生。5,口蹄疫一般冬末春初发生，而水泡病一年四季都可发生。6,口蹄疫鼻盘上的泡透明而薄而水泡病的泡皮厚。7,口蹄疫的泡破以后触碰有痛感，而水泡病没有那么疼。
（以上为本站整理农技人员经验所得，仅供参考）