鸡感染支原体的临床症状表现为呼吸道感染，有咳嗽、打喷嚏、气管啰音、鼻液堵塞鼻孔、甩头、眼内有泡沫型分泌物。病鸡先是流稀薄或黏稠鼻液，打喷嚏，鼻孔周围和颈部羽毛常被沾污。其后炎症蔓延到下呼吸道即出现咳嗽，呼吸困难，呼吸有气管啰音等症状。病鸡食欲不振，体重减轻消瘦。个别病鸡表现眼睑肿胀，眶下窦肿胀、发硬。眼内有干酪样渗出物，眼球受到压迫，发生萎缩和造成失明，可以侵害一侧眼睛，也可能两侧同时发生。母鸡常产出软壳蛋，同时产蛋率和孵化率下降，后期常蹲伏一隅，不愿走动。鸡支原体感染后，不仅会引发呼吸道症状，还会引发关节炎、气囊炎、腹膜炎、鼻窦炎等各种炎症，并发感染的病情很难医治，且恢复较慢。