高致病性猪蓝耳病的主要表现是发烧，体温骤然上升至41℃以上，同时伴有呼吸困难、器官水肿等症状。患猪会出现心跳加快、食欲不振，可能伴随拉稀或便秘。该病传播速度快，致死率高，对怀孕母猪会造成繁殖障碍，出现早产、流产、死胎等情况。
该病主要通过呼吸道传播，病原侵入后影响气体交换，引发呼吸道感染。典型症状包括：呼吸异常，皮肤出血充血；眼结膜炎、眼睑水肿；咳嗽、气喘等呼吸道症状；部分猪出现后躯无力、共济失调等神经症状。仔猪发病率可达100％，病死率达50％以上，母猪流产率超过30％。
种母猪症状尤为明显，表现为高热、呼吸困难，不孕或早产，特征性的耳朵发蓝症状。病理变化可见脾脏边缘梗死灶，肾脏呈土黄色并有针尖大小出血点。
临床症状多样化，包括：皮肤发红发绀（耳部、口鼻、后躯和股内侧）；顽固性腹泻；当继发感染时病情加重，死亡率明显升高。显微镜检查可见脾脏出血性梗死。