以日常加强饲养管理为主，以药物治疗为辅，防治结合，栏干食饱、通风保暖、药物保健、做好基础免疫、增强机体抵抗力等综合防控措施。调节肠道菌群，从而促进止泻和肠道恢复。补水：由于病毒性腹泻常引起仔猪严重脱水，是仔猪死亡的直接原因，因此补水必不可少。给仔猪口服金葵花九仔康，10日龄以内的仔猪，每次给5毫升口服补液盐，每3个小时补一次；仔猪10-30天，每天重复3-5次，保证仔猪水分和体能充足，恢复快。
防脱水和酸中毒，饮水补液盐或多维葡萄糖，稳定病情。在对于仔猪病症时，有些养殖户喜欢停料或停奶一天，以空腹让肠道益菌核粘膜自行恢复的措施来治疗。这种方法对部分仔猪也是可行的，但是一定要注意补充营养，以防脱水，可饮水补液盐或多维葡萄糖，水中稍加一些小苏打，但是要注意待稍微稳定后配合庆大霉素等抗菌药物预防复发。抗生素控制继发感染，减少死亡率。
在对于断奶后仔猪和成年猪的治疗方案上，通常推行病毒与细菌同步治疗的方法。习惯用干扰素的朋友，可用干扰素配合百分之三十的氟苯尼考注射，肌肉注射一边一针，至少要连用两天。不习惯用干扰素的朋友，可用抗病毒药物如黄芪多糖配合广谱抗菌药物使用，前期治疗效果不错，可大大降低死亡率。前几天治愈一例仔猪传染性胃肠炎，用了这种方法：断料一天，但注意补充体力，饮水补液盐，防止脱水。同时口服庆大霉素，肌注阿托品。但是阿托品为紧急封闭药物，治疗时不可过多使用。