根据临床表现、病理变化和流行病学可作初步诊断。2～6月龄小羊容易发病，主要经口感染。轻者出现软便（似牛粪样），重者发病初期体温升高后下降，主要症状为急剧下痢，排出黏液血便且恶臭，并含有大量卵囊。病羊贫血、消瘦、食欲不振，一般发病后2～3周恢复。耐过羊可产生免疫力，不再感染发病。
粪便检查可采用饱和盐水漂浮法检查卵囊，也可对球虫结节进行涂片或切片检查，发现大量卵囊或不同发育阶段的裂殖体、配子体即可确诊。
