根据临床表现、病理变化和流行病学可作初步诊断。粪便检查可采用饱和盐水漂浮法检查粪便中的卵囊，也可进行球虫结节的涂片或切片做病原检查，发现大量卵囊或不同发育阶段的裂殖体、配子体即可确诊。
2～6月龄小羊容易发病。主要经口感染，轻者出现软便（似牛粪样）。重者发病初期体温升高，后下降。主要症状为急剧下痢，排出黏液血便，恶臭，并含有大量卵囊。病羊贫血，消瘦，食欲不振，疝痛等。一般发病后2～3周恢复，耐过羊可产生免疫力，不再感染发病。
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