瘤胃内含有纤毛虫等大量有益的微生物，这些微生物在瘤胃消化分解草料过程中具有很重要的作用。牛羊口服抗生素会杀灭这些有益微生物，造成菌群失调和消化机能障碍。
瘤胃微生物以纤毛虫、乳酸菌等有益菌为主，它们帮助牛消化饲草饲料。给牛羊等草食动物口服抗生素会杀灭瘤胃内的有益细菌，降低动物消化能力。同时，抗生素还会破坏瘤胃微生物平衡，影响瘤胃的正常消化功能。因此这种做法不可取。
