C型产气荚膜梭菌为革兰氏阳性、有荚膜、运动的厌氧大杆菌，在中央或近端形成卵圆形芽胞。主要产生α和β等外毒素，引起肠毒血症和坏死性肠炎。
C型产气荚膜梭菌侵入猪体后，到达消化道空肠，首先侵入肠绒毛上皮组织，沿基底膜繁殖、扩散，并产生毒素，使绒毛上皮脱落，绒毛固有层完全坏死。进一步发展，坏死区扩展到黏膜肌层和黏膜下层，甚至侵人浆膜肌层。少数细菌穿入肠壁，在黏膜下层、浆膜下和附近肠系膜淋巴结内繁殖，产生气体，形成气肿。在坏死过程中，由于肠壁血管遭到破坏，造成严重出血，以致肠内容物中含有多量血液。病仔猪可因毒素吸收形成毒血症，或因肠黏膜的严重坏死，或因继发菌造成的菌血症等原因而死亡。
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