猪支原体肺炎的病变部位主要在猪的肺部、肺门淋巴结和纵膈淋巴结，肺部两侧都有明显的肿大现象，而且有不同程度的水肿，在心叶、中间叶上出现融合性支气管炎变化。病变部位的颜色为灰红色，而且是半透明状，病变部位的界限比较明显，被称为肉变。随着病猪的病情加重，病变部位的颜色也会变深，呈现紫红色或者灰白色带泡沫的浆性或黏性液体。主要发生在尖叶、心叶、膈叶和中间叶的前腹，如果解剖病死猪时见到上述病理变化，往往提示有MH的感染。这种病变非常具有指示性，是特征性的病理变化。
