本病主要的病理变化为患猪消瘦，贫血，皮肤苍白，黄疸；淋巴结异常肿胀，肝脏发暗，呈浅黄到橘黄色外观，萎缩，肝小叶间结缔组织增生；肾脏水肿，脾脏轻度肿大，胰、小肠和结肠也常有肿大及坏死病变。
猪圆环病毒病的剖检变化有：全身淋巴结异常肿胀，切片均匀的白净，肺脏肿胀，坚硬似橡皮样，肝脏发暗，肝小叶间结缔组织增生。
猪圆环病毒病解剖变化本病主要的病理变化为患猪消瘦，贫血，皮肤苍白，黄疸(疑似PMWS的猪有20%出现)；淋巴结异常肿胀，切面为均匀的白色；肺部有灰褐色炎症和肿胀，呈弥漫性病变，比重增加，坚硬似橡皮样；肝脏发暗，呈浅黄到橘黄色外观，萎缩，肝小叶间结缔组织增生；肾脏水肿(有的可达正常的5倍)，苍白，被膜下有坏死灶；脾脏轻度肿大，质地如肉；胰、小肠和结肠也常有肿大及坏死病变。
病尸消瘦，淋巴结肿大4~5倍，切面泛白，腹股沟、胃、肠系膜、支气管等器官或组织的淋巴结特别突出。肺质地如橡胶般坚实，在正常的粉红色肺小叶间，出现有棕黄色至灰白色的小叶，整个肺脏为花斑状。肾颜色苍白，分布有白色病灶或肿得相当大，同样呈花斑状，脾脏也肿得相当大。在胃与食管中间出现大片溃疡。
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