免疫接种是预防羊群疾病的关键措施。每年春季或秋季，对健康羊群预防接种一次。山羊传染性胸膜肺炎氢氧化铝灭活疫苗，可预防由丝状支原体山羊亚种引起的山羊传染性胸膜肺炎；羊肺炎支原体氢氧化铝灭活疫苗，则用于预防绵羊、山羊由绵羊肺炎支原体引起的传染性胸膜肺炎。不适于接种的羊包括身体瘦弱、体温升高或有慢性疾病的羊。怀孕母羊、新生羔羊及从异地引进的羊应及时补接种。
在羊群中发现病羊和可疑病羊时，应立即对发病羊群进行封锁，并进行全群检查。病羊、可疑病羊和假定健康羊应分群隔离治疗。每天应对被污染的羊舍、场地、饲养用具和病羊的尸体、粪便等进行消毒；对病死、剖检羊尸体进行焚烧或深埋处理。
治疗方面，发病初期应选用敏感药物进行抗菌消炎、制止渗出、止咳平喘等治疗。由于支原体易产生耐药性，需注意药物交替使用和较长时间用药。常用药物包括新砷矾纳明、泰乐菌素注射液、土霉素注射液、氟苯尼考、林可霉素等。羊传染性胸膜肺炎应定期注射对应疫苗，治疗可使用青霉素加链霉素、土霉素等注射，但若治疗不及时，死亡率较高。
