原因有：1、机械性刺激或损伤：如各种异物(泥沙、杂草、碎屑、被毛或昆虫等)进入牛眼部，或者笼头压迫、睫毛内翻、寄生虫体等的刺激。2、化学药物刺激：如各种消毒药物或灭虫农药进入牛眼部。3、牛舍通风不良：牛卫生状况较差且通风不良的情况下，便会产生氨气、二氧化碳、硫化氢等有毒有害气体刺激牛眼部。4、邻近组织病变：如眼部周围感染化脓(上额窦蓄脓等)、眼部寄生虫(吸吮线虫等)，均可引起牛传染性角膜结膜炎。5、蚊蝇叮咬：当蚊蝇叮咬眼部时，同样可引起牛传染性角膜结膜炎。6、传染性疾病：可直接引起牛传染性角膜结膜炎的疾病有衣原体眼病等，可间接引起牛传染性角膜结膜炎的疾病有口蹄疫、牛流感等。本病在夏季和秋季发病率较高，主要是因为高温高湿及蚊虫引起的。该病可感染多种反刍动物，通过相互接触、打喷嚏传染，另外，也可通过蚊虫传播本病。