预防仔猪消化不良，首先要加强对怀孕母猪和初生仔猪的饲养管理，多喂富含蛋白质和维生素的全价饲料。初生仔猪加强护理，及早吃足初乳，及时补充全价颗粒料等等。
1.加强管理，尽快消灭发病原因，控制吮乳次数或停止吮乳。2.改善胃肠机能，服用一些促消化药物。3．抗菌消炎,加入消炎药。4.补液解毒，对于症状严重的，还要适时进行补液解毒。
由于仔猪消化不良的病因是多方面的，故对本病的治疗应采取食物疗法、药物疗法及改善卫生条件等措施的综合疗法。首先改善哺乳母猪的环境，加厚铺垫干燥、清洁的褥草，为缓解胃肠道的刺激作用，可禁止仔猪哺乳8～10小时，此期间仅给以生理盐水溶液（氯化钠2克，33%盐酸0.3毫升，凉开水300毫升，每天3次）。为排出胃肠内容物，对腹泻不甚严重的仔猪，可内服甘汞（每千克体重0.01克）。为促进消化，可内服人工胃液（胃蛋白酶10克，稀盐酸5毫升，常水1000毫升）10～30毫升。为防止肠道感染，特别是对中毒性消化不良的仔猪，可选用抗生素（链霉素、卡那霉素、土霉素、痢特灵、磺胺类药物）治疗。对持续腹泻不止的可内服止泻剂（如明矾、鞣酸蛋白、次硝酸铋、矽碳银等）。为防止机体脱水，可静脉或腹腔注射10%葡萄糖溶液或0.9%氯化钠溶液。