林下养鸡的主要常见病是球虫病和大肠杆菌病。体外寄生虫有虱和螨。此外，还需防范野犬、黄鼠狼、狐狸和鹰等天敌。由于鸡群自行觅食，可能摄入带有寄生虫的虫类，因而在饲料中加入适量驱虫药物是必要的。同时，维持环境卫生，定期进行消毒处理，能有效预防传染病，保障鸡群健康。
