羊角膜炎主要由摩拉菌属的病原菌所引起，患羊或带菌羊是主要传染源，主要通过直接接触进行传播。本病常发生于天气炎热和湿度较高的夏秋季节，因为这种环境下更利于致病菌的生长繁殖和传播。冬季羊舍封闭过严，舍内温度高、湿度大、氨气多也会增加本病的发病率。此外阳光暴晒、风沙、扬尘、蝇类频繁活动也会促进本病的发生和流行。
患病的原因是羊角膜受到长时间的强光刺激，或羊眼结膜囊内进入沙粒等异物，导致结膜、角膜损伤，此时多种病原体引发感染。病原体在病羊体内大量繁殖，随眼分泌物和炎性渗出液排出体外，污染圈舍、饲草、饮水而引发羊群感染。