猪传染性胃肠炎病毒是机理消化系统感染病毒引起，流行性腹泻病毒是季节性流感病毒引起外寒病毒入侵免勉力引起。两者的主要区别有：猪传染性胃肠炎对新生仔猪有较高的致死率。潜伏期较短，15-18h，有的延长到2-3天，传播快，2-3天可波及全群。猪传染性胃肠炎是由传染性胃肠炎病毒引起的以猪呕吐，腹泻，脱水为特征的传染病；流行性腹泻由猪流行性腹泻病毒引起的的以猪呕吐，腹泻，脱水为特征的传染病。
