剖检可发现盲肠及结肠有浅平溃疡或坏死，周边呈堤状，中央稍凹陷，表面附有糠麸样假膜，多数病灶汇合而形成弥漫性纤维素性坏死性肠炎，坏死灶表面干固结痂，不易脱落。
仔猪副伤寒剖检变化：1.急性型：主要是败血症变化。耳及腹部皮肤有紫斑;肠黏膜肿胀充血，有出血点；肠系膜淋巴结肿大、充血、出血；脾大，呈暗紫色，触之似橡皮样感觉；肝、脾、肾等脏器的实质内有粟粒大坏死灶；心外膜、浆膜、喉头及膀胱黏膜均有出血点。2.慢性型：典型病变为坏死性肠炎，主要表现在盲肠和大结肠。大肠黏膜增厚，有浅平溃疡和坏死，肠黏膜表面覆盖一层灰黄色麸皮样坏死物，剥开可见溃疡面。肠系膜淋巴结呈索状肿胀，有些病例，肝、脾、肾及肺脏表面有针尖大或小米粒大灰白色坏死灶。
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