本病急性型主要症状为血水样下痢，病程稍长排沥青样黑色粪便或血样粪便，并发生突然死亡，也有突然死亡仅见皮肤苍白而无粪便异常的病例。慢性型常见，8周~16周猪多发，表现为同一栏中不时出现间歇性下痢，粪便变软、变稀、糊状或水样，有时混有血液或坏死组织碎片;食欲减退，吃几口就走，甚至废绝;病猪消瘦，被毛粗乱，弓背弯腰，有的站立不稳，病程长的皮肤苍白，治疗不及时可成为僵猪。造成最大危害的是亚临床型，多发于6周~20周(即因为病菌持续存在，基本整个育肥期都可发病)，症状轻微或无明显腹泻，但生长速度和对饲料利用率明显下降，对饲料利用率可降低17%~40%，平均减缓育肥猪日增重24%，出栏时间至少延长14天。据估计在中国回肠炎造成每头猪平均损失为12元~30元。