在小龙虾苗种运输的过程中如果有用到冰块的话，必须中间要隔一层水草或袋子，这样虾不容易死亡。尽量不要用泡沫箱，即使是用泡沫箱的话，里面也不能用到冰块。否则死亡率会达到70%-80%。这种运输方式一般只是用来运送成品虾。
1、由于虾苗生产期气温偏高，应在早、晚气温偏低时装运。长途运输可用空调车或加冰块降温，但必须注意逐步降温，下车时逐步升温，防止温差太大。2、运输时做好衔接工作，检查好运输工具，以免发生故障。做到快装、快运、快下塘。虾苗下塘前将尼龙袋放入塘内15～20分钟，待袋内水温与塘水水温基本一致时再放苗入塘。3、装苗用水最好是塘水，但必须清新不肥，无污染。一般不用自来水，如必须用自来水也应先曝气，提前将自来水放置在容器内备用。4、虾苗下塘前先把虾苗放入用密网布制作的网箱内，投喂煮熟的蛋黄浆，虾苗饱食后将网箱的一头压入水下，让虾苗自己游出。