养蟹稻田由于水层较深（10-30厘米），田间通风透光性差，湿度大，易导致水稻纹枯病流行。防治应采取以下措施：
一、农业防治
1.菌源控制：春季灌水整地时打捞菌核，带出田外深埋或烧毁；清除田间及田边杂草；使用充分腐熟的稻草作肥料。
2.品种选择：选用抗倒伏、抗病性强的水稻品种。
3.田间管理：
整地时在田四周挖30厘米深、50厘米宽的蟹沟，便于排水晒田时河蟹栖息。
以有机肥为基肥为主，追肥6月10日前完成。施追肥时蟹苗需暂养于网箱或土池，6月中旬换水后放回。
二、化学防治
当分蘖末期穴发病率达5%以上或拔节至孕穗期达15%-25%时，在分蘖末期至齐穗期，每亩用5%井冈霉素150毫升兑水100公斤喷雾，10天后再喷一次，防治效果可达90%以上，且对河蟹安全。