养殖草鱼具有饲料成本低、价格较高、经济效益明显等特点，草鱼本身也具有肉质细嫩、肉刺少、生长快等优势，是一个优良的主养、配养品种，广大渔民乐于养殖。但草鱼养殖也有病害多、死亡率高等缺陷，令养殖户蒙受一定损失。现将几种草鱼常见的疾病鉴别与防治方法介绍如下：
1、水花至乌仔阶段
车轮虫病：病鱼焦躁不安，身体与水草等硬物摩擦，病情重者在水面打转或顶水能力差，游动无力至死亡。可用0.7g/m³CuSO₄全池遍洒治疗。
白头白嘴病：鱼苗表现为白头白嘴，轻者仅吻端发白，重者自吻端至眼眶全白，可用二氧化氯、溴氯海因等治疗，忌用强氯精等强刺激性药物。
2、乌仔至体长10cm阶段
小车轮虫病：病鱼晴天中午浮于水面，较安静，俗称"暗浮头"，宜采用车轮虫专杀药物如车轮清等治疗。
3、体长10cm至250g鱼种阶段
斜管虫病：多发于清澈微流水池塘，病鱼在进水口处集群、浮头，鳃盖可见粘液增多呈浅蓝色。
指环虫病：病鱼焦躁不安，鳃盖闭合困难，鳃片边沿发白腐烂，可用0.5g/m³敌百虫或0.03g/m³菊酯类鱼药杀灭。
烂鳃病：病鱼游动无力，头部发黑，鳃盖内表皮腐蚀成透明圆斑，俗称"开天窗"，用二氧化氯、溴氯海因等治疗。
4、体重250g至成鱼阶段
初春阶段常见中华鳋、锚头鳋等寄生虫并发感染。
肠炎病：肛门红肿外突，轻压腹部有黄色或淡红色粘液流出，用复方磺胺类药物拌饲投喂。
病毒性出血病：分三型：红鳍红鳃盖型、红肌肉型和肠炎型，该病无特效药，应以预防为主，治疗时可内服杀菌抗病毒药物结合泼洒碘制剂。