鳖苗进池前不慎受伤，鳖体消毒不严，鳖的放养密度过大等，容易造成病原体对鳖体的感染。此外，室内气温较低，甲鱼池控温差，池水清瘦也是引发此病的原因之一。
在流水池和循环水槽中养殖的甲鱼容易发生白斑病。当甲鱼潜入泥沙中，皮肤受伤时容易感染白斑病，患病甲鱼在前期死亡率比较低，但当毛霉菌逐渐蔓延到咽喉部的时候，就会导致甲鱼因为呼吸困难而死亡。
发病期白斑病在水温25℃左右时最易发病，驯养开食或长途运输后的稚甲鱼、幼甲鱼发病率最高，室内气温较低、控温差的温室甲鱼池也极易发生，池水清瘦也是引发此病的原因之一。