病畜的肠道表现出明显的病理改变。病理解剖表明，猪传染性胃肠炎病会导致病畜的肠道黏膜受损，表现为溃疡、内皮细胞变性和消失，肠道腺体也会受到破坏，从而引发腹泻、呕吐等症状。同时，病畜的消化系统受到严重影响，消化能力受限，肠道蠕动不规律，导致消化不良和营养摄取障碍，体重下降，甚至出现营养不良。此外，病畜的免疫力受损，更容易感染其他疾病，且疾病持续时间更长。
