临床症状和体征是猪小叶性肺炎的重要诊断依据。患病猪表现出咳嗽、打喷嚏、鼻腔分泌物增多等上呼吸道症状，同时还出现发热、食欲不振、精神萎靡等全身症状。体格检查时可发现呼吸急促、呼吸困难、肺部啰音增多等肺部体征。
病理学检查是确诊猪小叶性肺炎的重要手段之一。通过对患猪的死体进行解剖、组织切片和病变部位的病理学检查，可以发现肺部病变的特征性改变。猪小叶性肺炎的病理学特征是肺泡间隔增厚、炎细胞浸润、肺泡内有炎性渗出物等。
病原学检查也是诊断猪小叶性肺炎的重要手段之一。通过采集病猪的呼吸道分泌物或肺组织，进行病原学检查，可以检测出引起猪小叶性肺炎的病原体。目前常用的病原学检查方法包括细菌培养、PCR技术、ELISA等。
此外，血液学检查也可以协助诊断猪小叶性肺炎。患猪的血液中常常出现白细胞计数增高、中性粒细胞比例增加等炎症指标的改变。