保持干净的饮水环境是预防仔猪水肿病的重要措施之一。饮水器及喂食器要定期清洗消毒，确保饮水器中的水质清洁卫生，不受细菌的污染。
合理的饲养管理也是预防仔猪水肿病的关键。养猪场要保持合理的温度和湿度，避免温度过高或过低，以及湿度过大或过小。仔猪的饲喂量要适当控制，避免过度喂食导致胃肠道问题。此外，给予仔猪足够的运动空间，避免过度拥挤，减少感染疾病的机会。
注重饲料的选择和营养均衡是预防仔猪水肿病的关键之一。饲料中的营养要均衡，包含足够的蛋白质、矿物质和维生素。对于刚出生的仔猪，应采用高能高蛋白的饲料，以满足其生长发育的需要。
定期兽医巡诊和疫苗接种也是预防仔猪水肿病的重要手段。定期请兽医进行巡诊，及时发现疾病问题，采取相应的措施。同时，按照兽医的建议进行疫苗接种，提高猪只的抵抗力，减少疾病的发生。