物理处理是将粪便和尿液进行分离，并利用物理手段对其进行处理。一种常见的方法是通过离心分离，将尿液和固体分离，然后对固体进行脱水和干燥处理。这种处理方法可以减少粪便对环境的污染，并将固体废物转化为有机肥料。
化学处理主要是利用化学方法对粪便中的有害物质进行处理。常见的化学处理方法包括氧化、还原、沉淀和中和等。其中，氧化是通过添加氧化剂将有机物转化为无机物，还原则是将无机物还原为可利用的有机物。沉淀和中和则是通过添加化学药剂使废物中的有害物质沉淀或中和，从而减少其对环境的污染。
生物处理是利用微生物或其他生物体对粪便进行降解和转化。常见的生物处理方法包括厌氧消化和好氧堆肥。厌氧消化是指将粪便投入到封闭的容器中，通过微生物的作用将有机物分解为沼气和有机肥料。好氧堆肥则是将粪便与其他有机物一起进行堆积，通过微生物的作用将有机物分解为稳定的有机肥料。
除了上述的三种主要处理方法，还可以采用其他附加处理方法，如过滤、吸附、离子交换和电解等。这些方法可以进一步净化废水，并提高废物资源的回收利用效益。