猪口蹄疫和水泡病的病原体不同。猪口蹄疫由猪口蹄疫病毒引起，是一种高度传染性的病毒性疾病。而水泡病则是由猪水泡病病毒引起的，同样也是一种病毒性传染病。这两种病毒虽然都属于病毒科，但它们的类型和结构有所不同。
猪口蹄疫和水泡病的症状也存在一定的差异。猪口蹄疫的主要症状包括发热、食欲减退、蹄部溃烂、口腔溃疡等。而水泡病的症状则主要表现为皮肤和黏膜出现水疱，病猪可能还会出现呼吸困难、流涎等症状。总体来说，猪口蹄疫主要影响猪的蹄部和口腔，而水泡病则主要表现在皮肤和黏膜上。
此外，猪口蹄疫和水泡病的传播途径也略有不同。猪口蹄疫主要通过直接接触病猪或者间接接触被病毒污染的物体传播，也可以通过空气传播。而水泡病则主要通过病猪分泌物、排泄物和呼吸道飞沫传播。
预防措施也有所区别。猪口蹄疫的预防主要包括加强养殖管理、提高猪群的免疫力、隔离患病猪只等。而水泡病的预防措施则主要包括定期对猪群进行疫苗接种、加强环境卫生管理、隔离患病猪只等。