肉牛长途运输需要做好检疫申报是基于对动物疾病的预防和控制的需要。在运输过程中，动物会面临各种压力和风险，如环境变化、接触其他动物等，这些都可能导致疾病的传播。因此，检疫申报要求运输方提供相关证明和文件，以确保肉牛的健康状况，并减少疾病传播的风险。
检疫申报还是保护国内畜牧业安全的一项重要措施。在国际贸易中，肉牛的运输往往涉及跨国边境，而不同国家和地区对于动物疾病的监管和控制标准可能存在差异。因此，通过检疫申报，相关部门可以对进口肉牛进行检疫和监管，以确保国内畜牧业的安全。
此外，长途运输中的肉牛也需要在目的地进行检疫申报。即使在国内运输，不同地区之间的疾病风险也可能存在差异。因此，运输方需要遵守相关规定，在运输到目的地后，按照当地要求进行检疫申报，以确保肉牛的健康和消费者的安全。