恶性口蹄疫病毒主要影响牛的口蹄，引起病牛的牙床、咀嚼肌和蹄的溃疡。这些病变会导致牛出现明显的口水、厌食、消瘦等症状，严重时可能导致牛死亡。
恶性口蹄疫病毒还可以引起牛的消化系统和呼吸系统的病变，包括胃炎、肠炎、肺炎等。这些病变会导致牛的消化和呼吸功能受损，进而影响牛的生命。
病毒感染会导致牛的免疫反应过度激活，引发炎症反应。这会导致牛的免疫系统受损，容易感染其他细菌或病毒，进一步加重牛的病情。同时，免疫系统反应过度激活还可能导致多器官功能衰竭，从而导致牛的死亡。
