物理消毒是一种简单而有效的消毒方法。这种方法包括清洗和热处理。清洗猪圈的表面和设备可以去除污垢和细菌，减少病原体的滋生。热处理是通过高温杀灭病菌和病毒。可以用高温水或蒸汽进行猪圈的清洗和消毒。这种方法不仅能有效杀灭病原体，还能清除猪圈中的异味和污垢。
化学消毒是常见的育肥猪圈消毒方法之一。常用的化学消毒剂包括漂白粉、过氧化氢、石灰等。这些消毒剂可以有效杀死病原体和细菌，预防猪圈传染病的发生。使用化学消毒剂时，要按照说明书的指导进行稀释和使用，避免对猪只造成伤害。
此外，紫外线消毒也是一种常用的消毒方法。紫外线具有较强的杀菌能力，可以杀灭空气中的细菌和病毒。使用紫外线灯对猪圈进行消毒可以有效地减少病原体的传播和滋生。但需要注意的是，紫外线消毒的效果会受到灯光照射时间和强度的影响，因此需要确保猪圈中的每个角落都能够得到足够的紫外线照射。
定期更换猪圈内的垫料和清理猪圈周围的杂草也是保持猪圈清洁的重要措施。新鲜的垫料可以减少细菌和寄生虫的滋生，而定期清理杂草可以减少害虫和病原体的栖息地，提高猪圈的卫生状况。