母牛的最佳配种方式主要分为天然配种和人工授精两种。天然配种是指将雄性牛和雌性牛放在一起，由雄性牛自然交配。人工授精则是将精液采集、加工后，通过人工方式注入雌性牛体内。选择最佳配种方式时，需考虑母牛的健康状况、生产力和繁殖能力。当母牛有疾病或生殖系统不健康时，应选择人工授精，避免传染疾病和影响母牛的健康。
母牛的最佳配种时间是在发情期间进行。母牛的发情期间每21天左右，持续1-2天。选择最佳配种时间，需根据母牛的发情情况、配种目的和配种方式综合考虑。天然配种可通过观察母牛的发情情况和行为，判断其是否处于发情期，并在发情期间将其与雄性牛放在一起。人工授精可通过注射促排卵药物诱发母牛发情，并在发情后进行精液注入。