荷花是水生植物，无水则不能生存。而怕水是指水位过高则难以开花，甚至全株死亡。由于品种不同，对水深的要求也不同。如生长在武汉东湖的红莲，在水深1.5米时，只见几片浮叶，立叶已全部淹于水中，无立叶便不能开花。立叶淹没10天以上，便有淹死之险，即使淹没3-5天，虽还维持生存，但当年则不易开花。
适于荷花生长的水位，一般不超过1米，中小型花种应在15-20厘米之间。生长季节如缺水，若泥土尚未干透（还湿润），及时灌水尚可恢复，但生长也会受到一定影响；如泥土已干至龟裂，则生长停滞、叶片枯焦，难以复生。
荷花虽依赖水生长，但不同生育期对水的要求亦不相同。分栽莲藕时，水分不宜过多，分栽后也不必立即浇水，待3~5天后泥面开始稍有龟裂时，浇少量水，这时尚未萌发，水分蒸发量很小，不会因干旱而伤及植株，而且控制水量既能避免种藕飘浮，又可提高泥温，对早期生长有利。早期应以保持浮叶和立叶出水为准，随着立叶的生长，逐渐提高水位。夏季气温高，生长迅速，故缸栽的1-2天加一次水；盆碗莲则应每天加水。夏季所用的水，水温应与缸内温度大体一致。