桧柏锈病主要危害桧柏的针叶和嫩枝，初期表现为黄色斑点，随后隆起并顶破表皮，露出红褐色的圆锥形或鸡冠状物，这些可能是单个或多个相连的冬孢子角。春季雨后，这些冬孢子角会胶化成橙黄色花朵状的胶状物，表层面含有冬孢子。
该病害的菌丝在桧柏上越冬，次年春季产生冬孢子角，遇雨后萌发产生担孢子，通过风力传播。在春季温暖多雨的年份，病害发生较为严重。
防治措施包括：冬季剪除桧柏上的重病枝；10至11月份在桧柏上喷洒0.3%五氯酚钠和1波美度石硫合剂的混合液，以预防锈病孢子的侵染；3月中下旬在冬孢子萌发前，喷洒1至2波美度的石硫合剂或等量式160至200波美度波尔多液2至3次，每次间隔7至10天。