杜仲枝叶茂密，萌蘖性强，属合轴分枝，干性不强，通常采用多领导干形的整形方式。苗期及时除去根蘖和多余萌蘖，培养端直主干。幼树定植2年后定干，春季萌芽后，选择3～5个枝梢培养成主枝，再将其余枝条剪去。由于枝条较多，可随意选择骨架枝，但成枝力较弱。以后每个主枝上培养2～3个侧枝，并适当修剪侧枝，把过密的侧枝及地面长出的一年生萌蘖苗剪去，以促进树干及主枝健壮生长。
成年树修剪，应注意保持树冠内空外圆，修剪手法应以疏剪为主，修剪时间以冬季为宜。早秋（9月）进行轻度换头，应根据主枝生长势的强弱适当修剪，一般剪去主枝延长枝的1/3，以增强生长势，并可防止无效秋梢萌生，促使枝条木质化。修剪时还应注意剪除病虫枝、枯枝、徒长枝、过密的幼枝及生长不匀称的枝。