红豆杉产地主要分布于东北、华南和西南地区、福建尤溪、四川、广西等地。四川主要分布在茂县、黑水、马尔康、汶川、泸定、康定、西昌、会理、米易等地区。
红豆杉产地还有中国东北黑龙江、日本、朝鲜、俄罗斯（阿穆尔州、库页岛等）东北亚地区。如：辽宁东部、吉林温带针阔叶混交林区。
我国红豆杉有4种1变种，分布于我国大部分地区。东北红豆杉主要分布在吉林省长白山和黑龙江一带，辽宁东部山区也有少量分布。云南红豆杉主要分布在滇西与地州16个县总面积约9万平方公里，其特点是分布广，生长分散，无纯林，多为林中散生木。南方红豆杉主要分布在滇东、滇西南、滇东纯林，多为林中散生木。湖南省邵阳市绥宁县朝仪乡老湾村、永州市双牌县阳明山绞车庙村、安徽省黄山市黄山区等地分布大量天然红豆杉。
四川、广西、山东等地也是红豆杉产地，均有大量的栽培，江西西部（宜春，铜鼓区域）和江西北部（瑞昌市肇陈镇大禾塘村境内，大约8万株）也有分布，西藏红豆杉主要分布在云南西北部，西藏南部和东南部。云南的红豆杉主要生长和分布在丽江、迪庆、怒江和大理等海拔2600∽3500米的山区，呈带状分布、数量十分稀少。在乳源县大桥镇这个仅有300多平方公里的小镇上，居然有10万多株红豆杉在此扎根！这是目前中国野生红豆杉生长最密集之处。