危害柚树的病虫害较多，常见的有螨类、蚧类、潜叶蛾类、炭疽病等，防治上应根据各种病虫的发生特点，结合喷药防治。
1、花前2月底到4月上旬，连续喷药2次，以防治螨类为主，同时结合防治其它害虫。
2、谢花后的幼果期5月中旬至6月下旬，连续喷药2次，以防治蚧类为主，同时结合防治其它害虫。
3、秋季7月中旬至9月上旬，连续喷药3-4次，以防治潜叶蛾为主，兼治凤蝶、炭疽病等。
4、9月中旬至10上旬是螨类危害的第二个高峰，应喷药1-2次杀螨，同时兼治其它病虫害。
5、冬季喷施一次石硫合剂清园。
杀虫剂可选乐斯本、敌百虫、灭扫利、大功臣等交替使用，杀菌剂可选多菌灵、托布津、代森锌等任一种，杀螨剂可选克螨特、灭螨灵等交替喷打，喷药应均匀周到。
柚子的主要病害：
溃疡病对柚子危害比较严重，由细菌引起，主要侵害新梢、嫩叶和幼果，防治方法以预防为主，综合治理：
(1)彻底清园。采收后剪除病枝、病叶，清理病果落果，就地烧毁。
(2)每次抽梢期及时防治传染病源的害虫。
(3)每次新梢露顶后及花谢后每隔10、30、50天喷一次药。
柚子的主要虫害：
螨类防治：可用73％的克螨特乳油2000-4000倍液、50％的三唑环锡1500-2000倍液等；
蚧类防治：可在幼虫发生期连续喷洒40％的氧化乐果乳油1000倍液；
柑桔潜叶蛾：可在新梢长到0.5-1.0厘米时每隔5-10天喷一次25％溴氰菊酯2500-3000倍液；
吉丁虫类：在成虫出洞高峰期，用80％的敌敌畏乳油1000倍液喷射树冠。