百合炭疽病又称鳞片黑腐病，主要在百合叶片、花和球根上危害。叶片上发病产生椭圆形淡黄色病斑，周围黑褐色稍下陷。花瓣、花蕾发病产生椭圆形淡红色的病斑，天气潮湿时或下雨后，叶片病斑上会长出很多黑色小粒点，就是病菌的分生孢子盘。发病严重时，病叶干枯脱落。侵染鳞茎后，初期产生不规则褐色斑，后呈浅黑褐色，褐色皱缩干腐，病斑可扩展深达几层鳞片，鳞茎贮藏过程中也可发病。
发病规律：病菌主要以菌丝体在病残组织内越冬；种用的鳞茎也可带菌传病。第2年在环境条件适宜时，病部产生分生孢子，通过风雨传播，引起初侵染。田间发病后，病组织上可以形成分生孢子，造成再次侵染。
防治方法：实行轮作和土壤消毒，冬季或收获后清除病残组织，减少菌源；避免鳞茎受损伤和过湿、受冻；种植密度要合适，改善通风透光条件，加强排湿；浇水不宜过多，控制氮肥施用过量；种植前种球用50％苯来特1000倍液或25％多菌灵500倍液浸泡15至30分钟进行消毒；发病期间喷50％炭疽福美500倍液，或50％施保功1000倍液，或25％炭特灵500倍液，结合喷雾还可用以上药液浇灌鳞茎，则效果更好。