利用多功能花盆进行盆栽的花卉，在上盆、管理和换盆清淤等方面与传统花盆有所不同。
1.换盆
多功能花盆底部设有贮水层，花卉根系活动范围较小，因此换盆次数和时间比传统花盆更加频繁。根据不同品种，通常一年换盆一次，若根系生长旺盛可半年换一次甚至按季节调整。换盆时间一般选择花卉萌发新叶前（春季3～4月）或秋末冬初休眠期。注意，生长旺盛期和开花期不宜换盆。
换盆技术方面，多功能花盆的内部构造较复杂，需先移除装饰盖或装饰物，排干贮水槽内的水。轻拍盆壁并倒置花盆，一手扶植株，一手轻敲盆底，使盆土脱离盆体，避免硬拔伤根。脱盆后适当修剪根系并更换新土，新盆应比原盆大一个型号。换盆后可修剪枯枝、病枝和不整齐枝叶。
若仅换盆不换土，则保留部分原土坨，修剪旧根后垫入新基质，填入空隙并浇水即可。装饰物清理后可重新使用。
2.清淤
清淤是使用多功能花盆的特有管理措施，因浇水时部分土壤会随水流至贮水槽，长期积存会影响贮水量和通风透气功能。通常在半年至一年间需清淤一次，具体视淤积情况而定。
操作方法类似换盆：取出植株和土坨后清除贮水槽内淤积的泥土，重新装回即可。清淤可与换盆同时进行，也可单独操作以维持花盆功能。