树坯造型需因材构思、因材造型，特别是自然类树桩造型，不可死搬硬套规律类树桩造型方法。树坯的加工造型方法主要分为蟠扎法和修剪法。
修剪法一般是在蟠扎基本造型后进行的，包括平剪、选剪等。岭南派盆景造型则采用纯粹的修剪方法，即蓄枝截干，这是受中国画法中鸡爪枝、鹿角枝造型的影响。蓄枝是指选定技位后蓄养技条，包括将来要成为树干的部分和根系；截干是指把不符合造型要求的树干、枝条及根系截短或截除。树坯挖掘后按造型要求长短、高矮进行截干、截根，定植萌发新技后选定技位，矫正带引技形朝向，蓄养到粗细合度时进行剪截，反复交替，直至鹿角、鸡爪技成型。其他盆景流派的修剪方法则各有侧重，如重扎轻剪、轻扎重剪或重扎重剪。
播扎法使用棕丝或金属丝对树桩进行造型。棕丝蟠扎属传统方法，将树干或树枝作成半圆型的弯子，称为汉文拐。川派树桩盆景中，棕丝操作有搭丝、翻丝、偷丝、留结等技巧，弯子有半弯、新月弯、一寸三弯、米弯等。金属丝蟠扎简便易行，屈伸自如，但拆出麻烦，常用铅丝。金属丝粗细根据树干和树枝的粗细确定，14号至20号丝较常用。蟠扎时，先将金属丝一端固定在枝干基部或交叉处，然后紧贴树皮缠绕，边扭曲树枝(干)边缠绕，或左或右，丝与树干(枝)成45度角。若主干较粗不易弯曲，可对树干进行纵向或横向开口，川派树桩造型中对大树蟠扎则一般使用撬扛弯曲法。
提根法为了增加树桩盆景的艺术价值和欣赏情趣，对一般树根进行提根处理，使其基部显露一部分造型有力、稳健的根部在盆的表面。提根法通常用深盆高栽壅土法、深盆平栽水冲法、桶筐状砂上或砂石培根法。深盆高栽提根法是将树桩深植于盆中，逐年用竹棍由上而下掏去壅土，最后翻入浅盆中。深盆平栽水冲法是每次冲水时有意识让水流稍强冲击树蔸部，使泥土脱落树根逐渐显露。桶、筐状砂土或砂石培根法是用无底的木桶或无底筐将树桩围住，装入河砂或砂夹小卵石并时常在桶、筐内注入水肥，待树桩的根部成活深入砂上下部泥土中时，分若干次自上而下逐渐扒去砂石，最后去掉桶筐后展露根部，再植入相宜的盆内。
雕凿法为了使树桩显现其在大自然中经风雨雷劈而呈现的苍柏之态，可对树干进行人工雕凿，甚至可以劈开树干。由于大自然树桩的采掘日渐不易，人们多是在自己栽培的树木中选择粗壮的素材进行加工。如对神枝和舍利干的处理，将一株松柏类的树桩用雕刻工具按构思将其干较上部分树皮依吸水线扭曲、迂回剥去，显出树干木质纹路，然后涂上石硫合剂或防腐剂以避免病害，经过养护而成为一株苍劲的树根。