叶子区别：藿香的叶子比薄荷的要大，叶子基部呈心形，缺口较浅，叶面皱缩；薄荷的叶子基部呈楔形或近圆形，没有缺口，叶面平整。花朵区别：藿香的花长在主茎或是侧枝的顶端，花朵密集，呈圆筒状的穗形；薄荷花朵腋生。
一、叶子区别
藿香又被称为“大叶薄荷”，光从这一别名上就能明显看出来，藿香的叶子要比薄荷的叶片大。
除了比较两者叶子的大小以外，还可以注意看一看叶子的基部，就是跟叶柄相连的那个部位。藿香的叶子基部呈“心形”，且心的缺口是比较浅的。而薄荷的叶子基部则是楔形的，或者说接近圆形，即没有“心”形的那个小缺口。此外还有一点就是，藿香的叶面看起来有一种皱缩的感觉，而薄荷的叶子则更为平整。
二、花朵区别
藿香和薄荷虽然都为轮伞花序多花，但仍旧有较明显的区别。藿香的花的生长部位是在主茎或是侧枝的“顶端”，这在植物学上被称为“顶生”，并且藿香的花朵很密集，呈圆筒形的穗状。而薄荷花都生长在叶子和主茎的连接的地方，即“腋生”。简单地说，藿香的花是长在“头顶”上的，而薄荷花则长在“腋”下。