1、主要原因
（1）浇水太多：芦荟怕涝。如果一次性浇水太多，或者太勤的话，很容易导致烂根。
（2）细菌导致：如果浇水方法比较科学，那么可以考虑是否是根部有细菌。如果是这个原因，那么处理的时候就必须消毒了。
2、如何处理
（1）首先，将植株弄出盆，然后除去根部周围的泥土。用锋利的小刀将腐烂的部分削掉。直到健康的茎部，剪的一定要彻底，不要留下一点腐烂的部分，不然很容易继续腐烂，面积会更大。修剪过后，涂上一些草木灰以消毒。伤口晾干之后，将期继续栽种到盆中。可以适当涂抹生根素，加速生根。盖上塑料膜，大概半个月之后，就可以长出新的根了。
（2）如果观察到根部腐烂的情况并不是特别严重，那么可以不修剪，只是晾干就可以。不过，一般情况下还是建议修剪一下。不然很容易导致腐烂部分的扩大，如要再处理就会有困难。
（3）另外，下面部分的四五片叶子最好也要去掉，以减少蒸发。
（4）要将植株放在半阴的地方，通风也要好，以加速伤口的愈合。注意这段时间要少浇水。