1、品种难种，种苗难买
现在市面上网红百香果品种层出不穷，如香蕉百香果、红心百香果等，但受气候、地域因素影响，很多品种尝试种植后效果不佳。台农、紫香等常见品种的优质种苗也难求，市场上存在品种不纯、带病毒的劣质苗，影响种植质量。
2、种植技术缺乏，经验不足
虽然百香果看似易种，实际管理难度大。市面上种植技术资料稀缺，主要依靠实践经验传授，缺乏系统的指导，新手种植困难重重。
3、病虫害防治难
百香果病虫害种类繁多，治疗棘手。茎基腐病、绿斑病、病毒病等问题严重，一旦发病往往难救治。加上农户普遍存在重治疗轻预防、判断不及时等问题，经常错过最佳防治时机。
4、农资市场混乱
农药化肥市场假货泛滥，部分不良商家以次充好，导致农户不仅延误防治时机，还增加了用药成本。
5、自然灾害风险
台风、暴雨等不可抗力因素时常威胁种植，收益波动大。好年景后遇到灾害可能血本无归。
6、销售市场不稳定
虽然百香果市场潜力大，但销路、价格存在地区差异和波动，销售存在不确定性。
7、管理成本较高
搭架、除草、采收等环节需要投入较多人工，按每人每天150-300元计算，成本压力不小。
8、政策支持有限
虽然国家重视农业发展，但具体到百香果种植的补贴政策仍显不足。
