在石斛生长发育过程中，病虫害的发生还是比较轻的，主要有黑斑病、煤污病、石斛菲盾蚊和蜗牛等。石斛采收后，应该加强病虫害防治，为保证来年丰收打下基础。
1．在防治中必须坚持"预防为主、综合防治"的原则；
2．本着治早、治小、治了的方针开展病防措施；
3．及时清理墒面上的枯叶、杂草；杀虫杀菌用高效氯氰菊酯、甲霜恶霉灵、硫酸农用链霉素兑水喷雾墒面。
4．苗期及时防治根腐病：用含量20%菌根消和20%根腐灵兑水浓度50%喷雾根部。
