一般20到25摄氏度是艾草浸种水的温度，但这个时间也会因为艾草的品种以及储存的年份变化而变化。因为艾草种子的皮不是很厚，所以浸种的时间一般是一天左右，如果艾草的储存年份比较久，也可能需要更长的时间，最终结果是大半的种子变得稍微饱满一点。
在艾草浸种催芽之前需要进行消毒处理。首先用水冲洗种子两到三次，再用稀高锰酸钾浸泡艾草种子三十分钟，然后用水浸泡。这个过程是为了除去种子表面的病菌以及灰尘，为幼苗营造健康的外部环境。
浸水过程中必须始终保持水温在20到25摄氏度左右，温度降低要及时更换水，温度也不能高于25摄氏度太多，否则容易把种子烫死。有条件的可以直接在温室内进行催芽，只需要定时往种子表面撒一些水即可。