盆栽的牡丹花一般要在花期之前施肥一次，花期之后施肥一次，还有过冬之前再施肥一次。这是三次固定要施加肥料的时间节点。花期之前施加的是腐熟肥、磷肥，花期后施加的是磷元素和钾元素复合肥，过冬肥以有机肥为主。
每一次给牡丹花施加完肥料之后，就要及时浇灌水分，起到中和肥料浓度，防止土壤板结、肥温过高等情况。同时也是通过浇水，让肥料能够更加均匀的分散到土壤的各个土层之中，使得牡丹花根系能够吸收的更好。
不管使用哪种肥料，都应当在肥料使用之前，用清水勾兑稀释肥料浓度，以免用在土壤里形成肥害表现。另外，天气状况也会影响施肥效率，春夏秋午间强阳暴晒的环境内，是不可以追肥的，阴雨天气下也要停肥。