黄芪苗期生长缓慢。应勤中耕除草，出齐苗后可进行第1次中耕，此时苗小根浅，应以浅除为主；第2次在苗高5厘米左右结合第1次间苗进行，第3次在苗高8~10厘米，第4次在定苗时进行。到了第2年以后，则在4月、6月、9月各进行一次中耕除草。中耕除草时注意向土垄培土，使土垄保持原来的宽度。
黄芪育苗地要及早进行人工除草，保持田间无杂草，地表层不板结。
为了减少杂草生长，在播种后、出苗前，喷施除草剂——氟乐灵，除草可达到95%以上。
