1.农业措施。
①选用抗病品种。根据各地栽培习惯选用抗病品种，一般叶细长、果实为牛角形或羊角形的辣椒比叶大而阔、果实为灯笼形的甜椒抗病毒病，耐热比耐寒品种抗病毒病。较抗病的甜椒品种有农大22号、农发甜椒、农乐甜椒、中椒5号、甜杂6号、充州1号。及时清除病残体，增施磷、钾、锌、钙肥，叶面喷施微肥，增强抗病力。
②种子消毒处理。用10%磷酸三袖浓液浸种20-30分钟，洗净。或将充分干燥的种子置于70℃的恒温箱内干热处理3天。
③苗床消毒。选择新床地块，起出苗床土，每立方米土加50%多菌灵100克拌匀过筛后填于苗床内，再用50%多菌灵加50%乙磷铝锰锌，按每平方米各10克加细干土拌匀，撒人畦面划锄入土。
④适时浇水。高温时可5~10天浇一遍水，以增大温差减轻发病。
⑤间做遮阳。采用先进技术，推广应用遮阳网，防止高温和烈日暴晒；或采用与玉米、豇豆、菜豆、瓜类等高杆作物间作。
2．药剂防治。
幼苗期，定植缓苗期及中后期要及早治蚜虫防病。目前防治病毒病尚无特效药物，应以预防为主，根据现有的药物配合使用，尽量抑制病毒病的发生。可用5%菌毒清300倍液，1.5%植病灵500倍，硫酸锌800倍（或高锰酸钾1000倍）再加入绿芬威1号1000倍；也可用5%菌毒清300倍，20%病毒A500倍，磷酸三钠500倍，再加黄腐盐；2.8%克病灵500倍，辣椒灵1000倍再加叶面肥等。