根腐病由腐皮镰孢菌引起，多发生在椒苗定植后的营养生长期。防治方法：
一、精选品种。选好并整好育苗地块。选择优质品种，并对种子进行浸种+种衣剂+新高脂膜处理，并适期播种。
二、田间管理。①精耕细整土地，悉心培育壮苗，在移植时尽量不伤根，精心整理，保证不积水沤根，施足基肥。②定植后要根据气温变化，适时适量浇水，并喷施新高脂膜，防止地上水分蒸发、苗体水分蒸腾，隔绝病毒感染。要喷施叶面肥，促花芽分化，多开花，多坐果。③分别在花蕾期、幼果期、果实膨大期喷施辣椒壮蒂灵，增强植株营养匹配功能，使果蒂增粗，促椒体健康生长，增强抗病能力。并配合喷施“果蔬保健透明衣”（示范户正在招募中，详情登陆中国植保网查询）可起到液膜套袋作用，提高辣椒着色和光亮度，降低残毒提高品质。
三、药剂防治。发病初期用艾菌托+新高脂膜,隔7-10天一次，连续用药2-3次，减少病毒传播。