一、主要病害发生特点
1.病毒病。该病是由黄瓜花叶病毒和烟草花叶病毒侵染所致。苗期侵染辣椒，造成的损失最重。主要由蚜虫、汁液接触等传播，最终出现畸形，造成花叶、坏死、落叶、落花、落果，一旦被感染，发病率极高，传播迅速。
2.疫病。该病是由疫霉感染引起的真菌性病害。苗期、成株期均可受害，根、茎、叶、果实都可发病，前期根、茎染病造成死苗，中后期染病常造成整株死亡。移栽期该病传播快、易感染，会造成大片死苗，连作田发病较重，病菌孢子借风雨传播，迅速蔓延成灾。
3.细菌性斑点病。该病是辣椒上普遍发生的一种细菌性病害，旺长期易发生。常引起早期大量落叶、落花、落果。如果在长期的高温高湿条件下，叶片上的病斑不形成疮痂，而是迅速扩展为叶缘焦枯或在叶片上形成许多小斑点，之后引起叶片大量脱落。
4.炭疽病。该病是辣椒挂果期的重要病害之一。此病主要危害果实，特别是成熟果实。严重时，会造成果实大量腐烂，对产量影响极大。病菌主要通过风雨和昆虫传播。
二、防治措施
1.苗期预防辣椒病毒病、疫病。预防病毒病应在苗期就开始重视传毒媒介蚜虫的防治。在防治好蚜虫的基础上，从5叶期开始用20%病毒A可湿性粉剂800倍液喷洒辣椒苗，间隔10～15天再喷1次，能有效预防病毒病。在移栽前2～5天喷1次阿米西达悬浮剂1500倍液防治疫病，然后带药移栽，能很好地预防疫病、立枯病等，并能保证健苗移栽，减少该病传入大田造成大面积危害。
2.移栽后病害预防。根据移栽后大田辣椒病害的发生特点，应在移栽后3～5天喷1次阿米西达悬浮剂1500倍液或64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液防治疫病，历年重病连作田，间隔10～15天再喷1次。旺盛生长期叶面喷1次20%病毒A可湿性粉剂预防病毒病。初果期初见细菌性斑点病时，应及时用72%农用链霉素可湿性粉剂500液进行喷雾。重病田间隔10天喷1次，连喷2～3次。