1、番茄、辣椒发生脐腐病，大白菜、甘蓝发生心腐病，花椰菜叶片边缘发黄变褐枯死，芹菜心叶发黄叶缘焦枯，共同的原因是土壤中缺乏钙元素，从而诱发上述生理病害，通常与病原菌的入侵是没有关系的，但缺钙、缺硫的蔬菜，可能会给细菌性的病害提供乘虚而入的条件。
2、蔬菜微肥不足导致叶果变畸形，不少蔬菜苗期出现花叶、矮化、丛枝、线叶现象，一般为病毒引发的病害，但在基肥中施足锌肥或及时补施锌肥，就会减少或者不发生这种异常长势。
3、此外，气温和水分因子的变化，也可能引发蔬菜作物生理病害的发生，如番茄进入“拉十字”期，平均气温低于15℃时，果实可能会发生畸形，产量、品质都会受到影响。又如高温、干旱时，番茄可能会出现芽枯病，只要及时灌水降温就可缓解，而无须施用农药。